Distributed Folding nadert einde?

Nieuwe/kleine projecten zoals DPAD bijvoorbeeld, maar ook What Pulse en Ecology.

Moderator: Global Moderators

Plaats reactie
Gebruikersavatar
Witlof
Global Admin
Berichten: 44097
Lid geworden op: di jan 15, 2002 2:00 am
Locatie: Veldhoven
Contacteer:

Distributed Folding nadert einde?

Bericht door Witlof » vr sep 03, 2004 1:11 pm

Ik hoorde in de wandelgangen van DPC dat Distributed Folding op het punt staat te stoppen? Is dit waar? Wie heeft er antwoord en wat gaan/gaat de huidige(n) DF'er(s) doen als het is gestopt?

ColdFusion
Berichten: 29
Lid geworden op: di jan 20, 2004 10:37 am
Contacteer:

Bericht door ColdFusion » vr sep 03, 2004 1:37 pm

2004/09/02
DFP Roadmap

We would like to thank all of our users for their participation in the CASP 6 experiment. We have managed to predict a total of eight targets using DFP. While this is only a small fraction of the targets that were available, we chose some of the hardest ones to predict, and are anxious to see how the present method compares with our other more manual method, as well as other protein folding approaches, after the meeting in December.

After having put forth all our resources towards participation in CASP 6, we now need to step back and conduct a thorough analysis of our results, as well as an in-depth evaluation of all the methods used, including Distributed Folding.

Having limited resources available in our Structure group, we are faced with the following options:

1) Continue running DFP with the current algorithm, tweaking code in the process
2) Implement Boris Steipe's protein fragment libraries into the Phase II algorithm
3) Modify the Phase II algorithm into a true genetic algorithm
4) Shut down the DF project entirely to focus on development and improvement of our core algorithm via data analysis of available results
We feel that the project would benefit most from taking a break, namely the latter option, while we put our efforts towards providing you with a more robust, scientifically cutting edge platform.

We would like to extend our sincere thanks to all the users who have participated in the project over the past two and a half years. We are grateful for the countless CPU hours you have given us, for your improvement ideas, and for relentlessly testing any changes we made as we progressed towards better software. We have learned much about writing robust software, and we hope you have learned a little about the exciting world of protein folding.

With your help, we have been able to generate large amounts of scientifically significant data that has advanced our understanding of protein folding, and has enabled us to improve our folding algorithms, which may one day allow us to predict protein structure and folding pathways from sequence.

However, due to the aforementioned reasons, we have decided to bring the Distributed Folding Project to an end upon reaching the 10 billion target on the current protein or on October 1, 2004, whichever comes last. We truly hope that our loyal user community keeps checking back for future distributed projects, as we certainly intend to return with newer and better ideas.

With gratitude,

Christopher Hogue, Howard Feldman and the Distributed Folding team

bron

:)
..:: [DPC] Team ColdFusion ::..

Gebruikersavatar
Witlof
Global Admin
Berichten: 44097
Lid geworden op: di jan 15, 2002 2:00 am
Locatie: Veldhoven
Contacteer:

uhm

Bericht door Witlof » vr sep 03, 2004 3:48 pm

Ik snap er niets van :? Das engels :+ ;)

Wat houdt het nou in op korte termijn in het nederlands? :P

Gebruikersavatar
Witlof
Global Admin
Berichten: 44097
Lid geworden op: di jan 15, 2002 2:00 am
Locatie: Veldhoven
Contacteer:

poging 2

Bericht door Witlof » vr sep 03, 2004 6:08 pm

Heb het nog maar eens gelezen maar bedoelen ze nu dat ze 'tijdelijk' stoppen tot ze een betere client hebben of zo?

Gebruikersavatar
Witlof
Global Admin
Berichten: 44097
Lid geworden op: di jan 15, 2002 2:00 am
Locatie: Veldhoven
Contacteer:

DF tot 1 oktober

Bericht door Witlof » za sep 04, 2004 9:52 am

DF zou nog duren tot 1 oktober volgens: Distributed Folding stopt

Wie draaide dit nog en wat gaat er nu gedraaid worden na 1 oktober? :)

Gebruikersavatar
robkds
Berichten: 422
Lid geworden op: zo apr 04, 2004 9:22 am
Locatie: Dongen
Contacteer:

Re: DF tot 1 oktober

Bericht door robkds » za sep 04, 2004 8:43 pm

Witlof schreef:DF zou nog duren tot 1 oktober volgens: Distributed Folding stopt

Wie draaide dit nog en wat gaat er nu gedraaid worden na 1 oktober? :)

Ik draaide dit (met 1,9 GHz). Die gaat nu met de rest (=7,6 GHz) weer Folding@Home doen.
Goed man!

Gebruikersavatar
Witlof
Global Admin
Berichten: 44097
Lid geworden op: di jan 15, 2002 2:00 am
Locatie: Veldhoven
Contacteer:

F@H

Bericht door Witlof » zo sep 05, 2004 11:17 am

Ahaa, F@H :)

Heb jij misschien tijd om daar een topic over te maken op het forum hoe het er nu voor staat? Dus hoe het met DPC gaat en Division Brabant op daily en overall nivo en wat de vooruitzichten zijn?

Zelf zit ik nu, naast wat PC's op RC5, OGR en ID, TSC te doen ivm de Stampede. Als dat weer voorbij is moet ik weer wat anders leuks hebben :)

Plaats reactie

Wie is er online

Gebruikers op dit forum: Geen geregistreerde gebruikers en 1 gast